In Abhängigkeit der Hautproblematik werden entweder topische (äußerlich anzuwendende), systemische (im ganzen Körper wirkende) oder die Kombination beider Präparate verschrieben. Welche Therapie angewandt wird, hängt von der Art der Hautveränderung und deren Ursache ab. So braucht eine Hautwunde, die durch eine Verletzung von außen entstanden ist unter Umständen eine andere therapeutische Herangehensweise als eine Wunde, die das Tier sich durch ständiges Lecken selbst zugefügt hat. Oft liegt bei Hauterkrankungen, die nicht durch ein eindeutiges Ereignis von außen entstanden sind, eine Grunderkrankung vor und/oder das Tier hat bestimmte körperliche Voraussetzungen, die Hauterkrankungen begünstigen, wie z.B. Schlappohren oder sehr viele Hautfalten. Auf diese Weise besonders beanspruchte Haut kann sich dann schnell mit Erregern infizieren. Die Grundursache der Hautveränderung ist nicht immer auf der Haut zu finden. Manchmal liegen auch Stoffwechselerkrankungen oder immunologische Erkrankungen zugrunde. Diese müssen diagnostiziert und gezielt behandelt werden. Wie die Hautveränderung, aufgrund deren Sie Ihr Tier dem Tierarzt vorgestellt haben, behandelt wird, hängt von deren Tiefe und deren Dauer ab.

Je nachdem, was man angehen muss, wendet man entweder Antibiotika (antibakterielle) oder Antimykotika (pilztötende), Kortikosteroide (entzündungshemmende), Antihistaminika (allergische Reaktionen eindämmende), juckreizstillende und desinfizierende Präparate an. Immunsuppressiva (Wirkstoffe, die das Immunsystem unterdrücken) werden je nach Erkrankung auch verschrieben.

Das häufigste Hautproblem in der Veterinärmedizin ist die Pyodermie (eitrige Hautentzündung).

Die Pyodermien werden nach ihrer Tiefe eingeteilt:

1. Oberflächenpyodermien: Hier ist nur die äußerste Hornzellschicht (Stratum corneum) betroffen. Dies ist bei der Hautfaltendermatitis (Intertrigo), Hotspot (Pyotraumatische Dermatitis) oder bei einer bakteriellen Überwucherung der Fall. Das primäre Ziel ist hierbei die Keimzahl zu reduzieren, um die normale Hautoberfläche sowie die gesunde Hautflora wiederherzustellen. Dabei werden nur topische antiseptische Präparate verwendet in Form von Sprays, Shampoos, Gels, Salben, Cremes, Schaum oder Desinfektionstüchern. Eventuell müssen zusätzlich Entzündungshemmer angewendet werden.
2. Oberflächliche Pyodermie: Hier sind die Oberhaut (Epidermis) sowie der oberflächliche Teil des Haarfollikels betroffen. Bei der Welpenpyodermie (Impetigo), der mukokutanen Pyodermie (Entzündung beim Übergang von Haut und Schleimhaut) sowie bei der oberflächlichen Follikulitis (Haarbalginfektion) ist dies zu sehen. Diese Form der Pyodermie ist insbesondere therapeutisch frustrierend, da sie in den meisten Fällen wiederkehrt, solange man die Grundursache nicht erkennt und diese behandelt. Die Behandlung von oberflächlichen Pyodermien selbst ist abhängig von der Ausdehnung; gut begrenzte Wunden muss man wenige Wochen bis über die Abheilung hinaus äußerlich behandeln.Ist die betroffene Hautfläche zu groß um sie äußerlich zu behandeln muss man (zusätzlich) für mind. 3 Wochen systemische Antibiotika anwenden. Diese sind auch bis 1 Woche nach klinischer Abheilung zu verlängern.
3. Tiefe Pyodermie: Hierbei sind die Lederhaut (Dermis), Unterhaut (Subkutis) sowie der untere Anteil des Haarfollikels betroffen. Diese entsteht, wenn eine oberflächliche Pyodermie weiter fortschreitet oder durch ein Eindringen von Erregern in die tiefen Gewebeschichten. Ein typisches Beispiel ist hier die Furunkulose, die an verschiedenen Stellen des Körpers auftreten kann. Gängige Lokalisationen sind hierzwischen den Zehen (Interdigitale Furunkulose), an den Pfoten (Podofurunkulose), am Kinn (Kinnfurunkulose), der Nase oder im Fall von Liegeschwielen (Kallusfurunkulose). Wenn sich die Tiere daraufhin nun beispielsweise die Pfoten lecken (Akrale Leckdermatitis), kann sich die Entzündung noch weiter verschlimmern und weiter in die Tiefe vordringen.Um das Wiederkehren dieser Problematik zu unterbinden, ist auch hierbei die Diagnose der Grunderkrankung und deren Behandlung für den Behandlungserfolg notwendig. Die tiefe Pyodermie selbst benötigt meist die Gabe von systemischen Antibiotika 2-3 Wochen bis über die klinische Heilung der Wunden hinaus. notwendig, was nicht selten zu einer Therapielänge von 4-12 Wochen führt.Nicht jede Hauterkrankung ist infiziert oder klar nach Hautschicht einteilbar. Bei der Perianalfistel beispielsweise vermutet man eine autoimmune Ursache und es ist schwierig zu definieren, bei welcher Schicht die Entzündung aufhört. Therapeutisch werden Immunsuppressiva, manchmal in Kombination mit Glukokortikoiden und topisch anzuwendende Medikamente verschrieben.Wunden, sei es nach einer Rauferei, Unfall, geplanten Operation oder nach Verbrennungen, beeinträchtigen die Hautintegrität und benötigen regelmässige Pflege und je nach Komplexität, die Gabe von Arzneimitteln.

Alles, was eine Wirkung hat, hat auch eine Neben- bzw.  unerwünschte Wirkung. Zu den häufigsten Nebenwerikungen von systemisch anzuwendenden Medikamenten gehören Durchfall, Erbrechen, häufiges Trinken und Urinieren, Appetitlosigkeit oder auch erhöhter Appetit. Diese können für das Tier, aber auch für den Tierbesitzer unangenehm sein. Manchmal wird die Gabe der Arzneimittel nach dem Auftreten dieser Symptome vorzeitig von den Tierbesitzern beendet, was dann zu weiteren Komplikationen führen kann.

Die lange Gabe von systemischen Antibiotika kann belastend für das Tier sein und frustrierend für den Tierbesitzer. Eine regelmässige Gabe der Antibiotika ist zwingend für den Erfolg notwendig, was für die lange Dauer eine gute Organisation benötigt.

Darüber hinaus trägt eine Übernutzung von Antibiotika über längere Dauer erwiesenermaßen zur Bildung von antibiotischen Resistenzen bei.

Auch die topischen Behandlungen, wie beispielsweise das Shampoonieren, werden nicht von allen Tieren gleichermassen toleriert.